2016年里约奥运会是日本历史上获得的最多金牌数的一次，日本代表团在这届奥运会上获得了41枚金牌，位列金牌榜第4位。其中，日本在以下项目上获得了金牌：
在田径比赛中，日本选手福冈晋康在男子50公里竞走比赛中获得了金牌。福冈晋康在比赛中用时3小时41分03秒，成为了历史上第一位在奥运会上获得50公里竞走金牌的日本选手。
日本一直在柔道领域占据着主导地位，这次奥运会也不例外。日本选手在柔道比赛中获得了12枚金牌，其中包括两位女选手在女子柔道比赛中获得的金牌。此外，男子柔道比赛中，日本选手在5个不同的比重级别中获得了5枚金牌。
在游泳比赛中，日本选手藤田和之在男子200米蝶泳比赛中获得了金牌。藤田和之在比赛中以1分53秒40的成绩夺得了冠军，并打破了亚洲记录。此外，日本选手在男子400米自由泳和女子200米蝶泳比赛中也获得了金牌。
总的来说，日本在2016年里约奥运会上获得的41枚金牌中，除了以上三个项目，还包括了赛艇、拳击、体操、举重等多个项目。这些金牌的获得，不仅展示了日本运动员的实力，也进一步激发了日本民众对于体育运动的热情。